En general, es una buena idea mantener el kernel y los paquetes que vienen por defecto en la distribución linux que hayamos elegido para nuestro servidor. Recompilar el kernel te puede traer muchas aventuras, y la mayoría de las veces no serán muy agradables. Sin embargo, existen algunas ventajas que podrían empujarte a recompilar el kernel de Linux:

Ventajas

• Los kernels compilados para un hadware específico funcionan mucho más rápido.
• Podrás excluir módulos y otros componentes que no necesitas.
• Si tienes requisitos mínimos puedes añadirlos o modificar sus partes completamente desde el código fuente.

Desventajas

1. Tendrás la responsabilidad de mantener el sistema actualizado, añadir los parches de seguridad necesarios, etc.
2. Si no compilas el kernel correcto podrías encontrarte con fallos de sistema muy graves.
3. Requiere tiempo y conocimientos técnicos avanzados.